内在科学研究院总部位于德国，于2008年成立，并于2014年在美国成立分部。内在科学研究院旨在推动内在科学与外在世界的学科知识的联结，将科学的演绎推导与传统智慧的经验归纳融入的内在世界与现实生活中。

内在科学研究院由教育实践中心、社会公益中心、以及学术研究中心构成。目前已经与德国、美国、英国六所大学有跨学科博士研究的学术项目合作，并建立了拥有自主知识产权的六大课程模块体系；对专业性人士提供系列化专业性培训课程，对普通学员提供成长性学习小组、短期工作坊、与系统科学的培训计划，帮助个体找到各自内在成长的路径，并且培养出深层次的超越个体的意识；同时，也对社会提供公益性讲座及支持性公益活动；参与到群体性的变革性的发展之中。

内在科学院研究院（中国）成立于2018年，是内在科学研究院在中国的分部。通过和中国院校的学术合作，逐步完善内在科学研究院研究成果。通过在中国引入内在科学研究院的核心课程，搭建适应中国文化的内在科学课程体系，使每个个体、群体都迸发出新的生命力与创造力。